Tuomasmessuun kuuluu aina ehtoollinen. Ehtoollinen on kirkon sakramentti, jossa Kristus on läsnä. Ehtoollinen on yhteyden ateria, joka yhdistää meidät yhdeksi Kristuksen kanssa, mutta myös toisiimme.

Kaikki kastetut kristityt ovat tervetulleita ehtoolliselle.

Tuomasmessussa ehtoollista jakavat papit, diakonit ja vapaaehtoiset ehtoollisavustajat. Ehtoollisleipä on gluteenitonta ja saatavilla on myös alkoholitonta viiniä.